樞密院
- 秩従一品。天下の兵甲機密の務、宮禁宿衛・辺庭軍翼の征討成守・簡閲差遣・挙功転官・節制調度をすべて掌る。世祖中統四年に枢密副使二員・僉書枢密事一員を置き、至元七年に同知枢密院事一員・院判一員を置き、二十八年に知院一員・院判一員を増し、中書平章が院事を商量することとした。大徳十年に知院二員・同知五員・副枢五員・僉院五員・同僉三員・院判二員に増員し、至大三年に知院七員・同知二員・副枢二員・僉院一員・同僉一員・院判二員とし議事平章を革去した。延祐四年、北辺分鎮のため知院一員を増し、五年に同知一員を増した。以後定置として知院六員（従一品）・同知四員（正二品）・副枢二員（従二品）・僉院二員（正三品）・同僉二員（正四品）・院判二員（正五品）・参議二員（正五品）・経歴二員（従五品）・都事四員（正七品）・承発兼照磨二員（正八品）・架閣庫管勾一員（正九品）・同管勾一員（従九品）。掾史十四人、訳史十四人、通事三人、司印二人、宣使十九人、銓写二人、蒙古書写二人、典吏十七人、院医二人。
- 客省使：秩従五品。大使二員・副使二員。至元十四年に大使一員を置き、十六年に一員増、二十一年に副使一員増、延祐五年・天暦元年にさらに増員し、大使二員（従五品）・副使二員（従六品）と定めた。令史二人。
- 断事官：秩正三品。軍府の獄訟の処決を掌る。至元元年に断事官二員を置き、以後数度の増員を経て大徳十一年に四員増、皇慶元年に二員省いた。以後定置は断事官八員（正三品）・経歴一員（従七品）、令史六人・訳史一人・通事知印奏差典吏各一人。
行樞密院
- 国初、征伐の事があれば行枢密院を置いた。大征伐では行院と称し、一方一事のために設けられる場合はその処の行枢密院と称し、あるいは行省と代わって設けられ、事が終われば罷めた。
- 西川行樞密院：中統四年始置。官二員を設け四川の軍民課税・交鈔・打捕鷹房・人匠及び各投下の応管公事・節制官吏諸色人等・軍官遷授・征進等を管掌し、成都に置いた。至元十年に重慶に東川行枢密院を別置し官一員を設け、十三年に一員に併合、のち再び東川行院を分立、十六年に両川行院を罷め、二十八年に四川行院を成都に復立した。
- 江南行樞密院：至元十年、河南省統軍司・漢軍都元帥・山東行院を罷め、荊湖等路行院（官三員）・淮西行院（官二員）を置き調度軍馬を掌らせた。十二年に行院を罷め、十九年に揚州・岳州に行院各官五員を立て、二十一年に沿江行院、二十二年に江西行院を立て馬軍を江州、歩軍を撫州に戍させ、二十八年に岳州行院を鄂州に、江淮行院を建康に徙した。その後行院はすべて行省に帰した。
- 甘粛行樞密院：至大四年、甘州に行院を置き甘粛等処行枢密院とし官四員を設け軍務軍馬を提調させたが、のち甘粛省丞相が提調することとなり行院を罷めた。
- 河南行樞密院：致和元年、専ら調遣の事を管させるため分置し、天暦元年に罷めた。
- 嶺北行樞密院：天暦二年設置。知院一員・同知二員・副枢一員・僉院二員・同僉一員・院判一員・経歴一員・都事二員、蒙古筆且齊四人・掾史二人・克埒穆爾齊一人・知印一人・宣使四人。辺軍務を掌り大小の事宜をことごとく裁決した。
五衛（右衛・左衛・中衛・前衛・後衛）
- 右衛：秩正三品。中統三年に武衛として初置、至元元年に侍衛と改め、八年に左右中三衛と改めた。宿衛扈従及び屯田を掌り国に大事あればこれを調度した。二十年・二十一年・大徳十一年・至大元年・四年と数度の増減を経て、定置は都指揮使三員（正三品）・副都指揮使二員（従三品）・僉事二員（正四品）・経歴二員（従七品）・知事二員・照磨一員（従八品）、令史七人・訳史通事知印各一人。属十五――鎮撫所（鎮撫二員）、行軍千戸所十（正五品、達嚕噶齊・副達嚕噶齊各十員・千戸副千戸各十員・弾圧二十員・百戸二百員・知事十員）、弩軍千戸所一（達嚕噶齊一員・千戸一員・弾圧二員・百戸十員）、屯田左右千戸所二（達嚕噶齊二員・千戸二員・弾圧二員・百戸四十員）、教官二（蒙古字教授・儒学教授各一員、屯衛の行伍が耕戦の暇に国字・書記を習学するため設置、初め枢府選挙、のち吏部に帰す）。
- 左衛：秩正三品。至元八年に侍衛を改置。掌職は右衛と同じ。以後の増減を経て定置は都指揮使三員（正三品）・副都指揮使二員（従三品）・僉事二員（正四品）・経歴二員（従七品）・知事二員・照磨二員（従八品）、令史七人・訳史通事知印各一人。属十五は右衛とほぼ同様（行軍千戸所十・弩軍千戸所一・屯田左右千戸所二・教官二）。
- 中衛：秩正三品。至元八年に侍衛を改置。掌職は右衛と同じ。以後の増減を経て定置は都指揮使三員（正三品）・副都指揮使二員（従三品）・僉事二員（正四品）・経歴二員（従七品）・知事二員・承発架閣照磨一員（従八品）、令史七人・訳史通事知印各一人。属十五は同様の構成。
- 前衛：秩正三品。至元十六年、侍衛親軍から前後二衛を創置。掌職は同じ。定置は都指揮使三員（正三品）・副都指揮使二員（従三品）・僉事二員（正四品）・経歴一員（従七品）・知事二員・承発架閣照磨一員（従八品）、令史七人・訳史通事知印各二人。属十七――鎮撫所、行軍千戸所十、弩軍千戸所一、屯田千戸所二、門尉二（平則門尉・順承門尉各一員）、教官二。
- 後衛：秩正三品。至元十六年、侍衛親軍から創置。掌職は同じ。定置は都指揮使三員（正三品）・副都指揮使二員（従三品）・僉事二員（正四品）・経歴二員（従七品）・知事二員・照磨一員（従八品）、令史七人・訳史二人・知印一人・通事二人。属十四――鎮撫所、行軍千戸所十、弩軍千戸所一、屯田千戸所一、教官二。
その他の親軍・万戸府（要約）
- 武衛親軍都指揮使司（正三品。城隍の修治及び京師内外の工役・大都屯田等を掌る。至元二十六年、六衛六千人・大都屯田三千人・近路万戸府一千人を合わせ一万人で立て、以後増減を経て定置は達嚕噶齊一員・都指揮使三員（正三品）・副都指揮使二員（従三品）・僉事二員（正四品）・経歴二員・知事二員・照磨一員（従八品）、令史七人・訳史通事知印各一人。属十五――鎮撫所、行軍千戸所七・屯田千戸所六・教官二）
- 隆鎮衛親軍都指揮使司（正三品。居庸関南北口の屯軍徼巡盗賊を掌り、欽察阿蘇護軍三六九三人を東西四十三処に屯駐。皇慶元年に隆鎮万戸府から昇格。定置は都指揮使三員・副都指揮使二員・僉事二員・経歴二員・知事二員・承発兼照磨一員、令史七人・訳史通事知印各一人。属十二――鎮撫所、北口・南口・白羊口・牌楼口・古北口・遷民鎮・黄花鎮・蘆児嶺・太和嶺・紫荊関・隆鎮の各千戸所（各正五品、居庸関周辺の各関口に配置）
- 左右翼屯田万戸府（各従三品。鄂端巴実伯里迴還漢軍及び大名衛輝所属の軍・迤東迴軍を屯田に合わせる。至元二十六年設置。逹嚕噶齊・万戸・副万戸・経歴・知事・提控案牘各一員、令史各五人、鎮撫各二員。左翼は千戸所八（達嚕噶齊八員・千戸副千戸各八員・百戸五十九員・弾圧十六員）、右翼は千戸所四（千戸副千戸各四員・百戸五十二員・弾圧八員）
- 左衛率府（正三品。至大元年、江南行省の精鋭漢軍を東宮衛軍として立衛率府とし、延祐年間に忠翊府・御臨親軍都指揮司・羽林等への改称を経て六年に左衛率府に復した。定置は率使三員・副使二員・僉事二員・経歴一員・知事一員・照磨一員、令史七人・訳史知事知印各二人。属十五――行軍千戸所十・弩軍千戸所一・屯田千戸所三・教官三（蒙古字教授・儒学教授・陰陽教授各一員）
- 右衛率府（正三品。延祐五年、薩勒奇諾爾万戸府・迤東西直両万戸府・右翼屯田万戸府を合わせ立てた。率使二員・副使二員・僉事二員・経歴二員・知事二員・照磨一員、令史七人・訳史通事知印各二人。属七――鎮撫所、千戸所五、教官一）
- 河南淮北蒙古軍都万戸府（正三品。至元二十四年、四万戸鄂囉齊を蒙古軍都万戸府に改称、大徳七年に改称。延祐五年に鄂囉官・副鎮撫等を罷め、定置は都万戸一員・副都万戸一員・経歴一員・知事一員・提控案牘一員、令史七人・訳史通事各一人、鎮撫二員。所轄に巴咱爾万戸府（万戸・副万戸各一員、千戸所十翼）、済古爾台万戸府（万戸一員、千戸所七翼）、托里図万戸府（万戸・副万戸各一員、千戸所九翼）、和尚万戸府（万戸・副万戸各一員、千戸所六翼・砲手千戸所一翼・哨馬千戸所一翼）がある）
- 右阿蘇衛親軍都指揮使司・左阿蘇衛親軍都指揮使司（各正三品。潮河蘇沽両川の屯田及び宿衛城禁を掌る。至元九年阿蘇巴図達嚕噶齊として初立、至大二年に衛親軍都指揮使司と改称。それぞれ達嚕噶齊一員・都指揮使三員・副都指揮使二員・僉事二員・経歴二員・知事二員・照磨一員、令史七人・訳史通事知印各一人、鎮撫二員。行軍千戸所・把門千戸・本投下・所在県などの属を有する）
- 回回砲手軍匠上万戸府（正三品。至元十一年砲手総管府として設置、十八年に都元帥府、二十二年に万戸府に改称。逹嚕噶齊一員・万戸・副万戸各一員・経歴知事提控案牘各一員、令史四人・訳史一人、鎮撫二員。千戸所三翼）
- 唐古衛親軍都指揮使司（正三品。河西軍三千人を統べ征討に備える。至元十八年始立。定置は都指揮使三員・副都指揮使二員・僉事二員・経歴一員・知事一員・照磨一員、令史七人・通事訳史知事各一人、鎮撫二員、鄂囉官正副各一員。千戸所九翼、門尉三、教官二）
- 桂斉衛親軍都指揮使司（正三品。至元二十四年始立。定置は達嚕噶齊一員・都指揮使二員・副都指揮使二員・僉事二員・経歴二員・知事二員・照磨一員、令史七人・知印一人・通事訳史各一人、鎮撫二員。千戸所八翼）
- 延安屯田打捕総管府（従三品。析居放良人戸及び烏蘭済蘇田地の北来蒙古人戸を管理。至元十八年始設）
- 大寧海陽等処屯田打捕所（従七品。北京平灤等路の析居放良布哷齊等戸を掌る。至元二十二年総管府設置、元貞元年に総管府を罷め打捕所とした）
- 忠翊侍衛親軍都指揮使司（正三品。至元二十九年屯田府として始立、大徳十一年大同等処都指揮使司に昇格、至治元年忠翊侍衛と改称。定置は都指揮使三員・副都指揮使二員・僉事二員・経歴二員・知事二員・照磨一員、令史七人・訳史通事知印各一人、鎮撫二員。行軍千戸所十翼・弩軍千戸所一翼・屯田左右手千戸所二翼）
- 西域親軍都指揮使司（正三品。元貞元年設置官十一員、以後増減を経て定置は逹嚕噶齊一員・都指揮使四員・副都指揮使二員・僉事二員・経歴二員・知事二員・承発架閣兼照磨一員、令史七人・通事訳史知印各一人、鎮撫二員）
- 宗仁蒙古侍衛親軍都指揮使司（正三品。至治二年、伊奇剌斯人二百戸と蒙古子女三千戸・清州匠二千戸・屯田漢軍二千戸を合わせ立てた。定置は都指揮使三員・副都指揮使二員・僉事三員・経歴二員・知事二員・照磨一員、令史七人・知印二人・克埒穆爾齊二人・訳史二人、鎮撫二員。蒙古軍千戸所十翼・屯田千戸所、教官二）
- 山東河北蒙古軍大都督府（従二品。各路軍民の科差・征進・調遣・総攝軍馬を掌る。至元二十一年統軍司都元帥府を罷め蒙古軍都万戸府を立て、大徳七年に改称、延祐五年に罷め、天暦二年に大都督府に改立。定置は大都督三員（従二品）・同知一員・副使一員・経歴一員・都事二員・承発兼照磨一員、令史八人・訳史通事知印各二人・宣使五人・典吏三人、鎮撫二員。所轄に左手万戸府・右手万戸府・巴図万戸府・哈達万戸府・蒙古回回水軍万戸府・竒図噶万戸府があり、各府に万戸・副万戸・経歴・知事・提控案牘・鎮撫等を配し、千戸所七～九翼を管轄する）
- 左翊蒙古侍衛親軍都指揮使司・右翊蒙古侍衛親軍都指揮使司（各正三品。至元十八年、蒙古侍衛総管府を五衛の例により指揮使司に改め、大徳七年に改称。定置は都指揮使三員・副都指揮使二員・僉事二員・経歴二員・知事二員・承発架閣兼照磨一員、令史七人・訳史通事知事各一人・典吏一～二人、鎮撫二員。左翊は千戸所七翼、右翊は千戸所十二翼、教官各二）
- 虎賁親軍都指揮使司（正三品。上都路元籍軍人及び鄂囉の事を管領。至元十六年始立、以後増員を経て定置は都指揮使三員・副都指揮使三員・僉事二員・経歴一員・知事照磨兼承発各一員、令史七人・訳史通事知印各一人・典吏二人、鎮撫二員・都目一員。贊達勒齊・布哈・托克托穆爾・大和塔拉・楊・密喇卜和卓の六千戸翼から成る）
- 大都督府（正二品。左右欽察両衛・龍翊侍衛・東路蒙古軍元帥府・東路蒙古軍万戸府・哈喇婁万戸府を統べる。天暦二年欽察親軍都督府として始立、のち大都督府と改称。大都督三員（正二品）・同知二員（正三品）・副都督三員（従三品）・僉都督事三員（正四品）・経歴二員（従六品）・都事二員（従七品）・管勾一員・照磨一員（正八品）、令史八人・蒙古筆且齊二人・克埒穆爾齊二人・知印二人・宣使六人。所轄の右欽察衛・左欽察衛（各正三品。至元二十三年欽察衛として設置、至治二年左右に分置、天暦二年大都督府に撥隸）、龍翊侍衛親軍都指揮使司（正三品。天暦元年始立）、哈喇婁万戸府（守禁門等の応値宿衛を掌る。至元四年始置、天暦二年大都督府に隸す）を含む）
御史台
- 秩従一品。大夫二員（従一品）・中丞二員（正二品）・侍御史三員（従二品）・治書侍御史二員（正三品）。百官の善悪政治得失を糾察する。至元五年始立。以後品秩・員数の変遷を経て、二十七年に大夫以下品従各一等昇り経歴一員を置き、大徳十一年にさらに昇格、皇慶年間に中丞を増減、至治二年に大夫一員と定めた。定置は御史大夫一員・中丞二員・侍御史二員・治書侍御史二員、経歴一員（従五品）・都事二員（正七品）・照磨一員（正八品）・承発管勾兼獄丞一員（正八品）・架閣庫管勾兼承発一員（正九品）、掾史十五人・訳史四人・知印二人・通事二人・宣使十人・台医二人・蒙古書写二人・典吏六人・庫子二人。
- 殿中司：殿中侍御史二員（正四品）。至元五年始置（当初正七品、のち正四品に昇格）。大朝会の百官班序及び失儀失列の糾罰、在京百官の到任・仮告事故・出三日不報の糾挙、大臣入内奏事への随行、不可与聞の人の糾避を掌る。知班四人・通事訳史各一人。
- 察院：秩正七品。監察御史三十二員。耳目の寄任・刺挙の事を司る。至元五年始置十一員（漢人）、八年に六員増、十九年に十六員増し蒙古人を参用、二十二年に南儒二人を参用。書吏三十二人。
江南諸道行御史台
- 官の品秩は内台と同じ。至元十四年、揚州に始置しのち杭州・江州を経て二十三年に建康に遷り、東南諸省を監臨し各道憲司を統制した。初め大夫・中丞・侍御史・治書侍御史各一員を置き淮東・淮西・湖北・浙東・浙西・江東・江西・湖南の八道提刑按察司を統べ、十五年に江南湖北・嶺南広西・福建広東の三道を増し、二十二年に淮東・淮西・山南の三道を内台に撥隸、三十年に海北海南一道を増し、大徳元年、江南諸道行御史台として官九員を定め江浙・江西・湖広三省を監し江東・江西・浙東・浙西・湖南・湖北・広東・広西・福建・海南の十道を統べた。大夫一員・中丞二員・侍御史二員・治書侍御史二員・経歴一員・都事二員・照磨一員・架閣庫管勾一員・承発管勾兼獄丞一員、令史十六人・訳史四人・回回掾史通事知印各二人・宣使十人、典吏庫子台医は各有差。
- 察院：品秩は内察院と同じ。至元十四年、監察御史十員を置き、二十三年に蒙古御史十四員・書吏十四人を増し、さらに漢人御史四員・書吏四人を増し、以後定置は御史二十八員・書吏二十八人。
陝西諸道行御史台
- 官の品秩は内台と同じ。至元二十七年、雲南諸路行御史台に官四員のみで始置。大徳元年、雲南行台を京兆に移し陝西行台とし、雲南は改めて廉訪司を立てた。延祐元年に罷め、二年に復立し、漢中・隴北・四川・雲南の四道を統べた。定置は大夫一員・御史中丞二員・侍御史二員・治書侍御史二員・経歴一員・都事二員・照磨一員・架閣庫管勾一員・承発司管勾兼獄丞一員、掾史十二人・蒙古筆且齊二人・回回掾史一人・通事二人・知印一人・宣使十人・典吏五人・庫子二人。
- 察院：品秩は内察院と同じ。監察御史十員・書吏二十人。
粛政廉訪司
- 国初、提刑按察司四道（山東東西道・河東陝西道・山北東西道・河北河南道）を立て、至元六年に按察司が勧農事を兼ね、八年に河東山西道・陝西四川道を置き、十二年に燕南河北道を分置、十三年に省併により按察司を一度罷めたが十四年に復置し八道（江北淮東道・淮西江北道・山南江北道・浙東海右道・江南浙西道・江東建康道・江西湖東道・嶺北湖南道）を増立し、十五年にさらに三道（江南湖北道・嶺南広西道・福建広東道）を増し、十九年に西蜀四川道、二十年に海北広東道を増し福建広東道を福建閩海道と改称、雲南七路に雲南道、女直の地に海西遼東道を置いた。二十三年に淮東・淮西・山南の三道を内台に撥隸、二十四年に河西隴右道を増し雲南道を罷め、二十五年に海西遼東を罷め、二十七年に雲南按察司の治する処に雲南行御史台を立て、二十八年に按察司を粛政廉訪司と改称した。大徳元年、雲南行台を陝西に徙し雲南道を復立し、三十年に海北海南道を増し、以後定めて二十二道とした。各道に廉訪使二員（正三品）・副使二員（正四品）・僉事四員（両広・海南は二員、正五品）・経歴一員（従七品）・知事一員（正八品）・照磨兼管勾一員（正九品）を置き、書吏十六人・訳史通事各一人・奏差五人・典吏二人を配した。
- 内道八（御史台に隷す）：山東東西道（済南路に司を置く）、河東山西道（冀寧路）、燕南河北道（真定路）、江北河南道（汴梁路）、山南河北道（中興路）、淮西江北道（廬州路）、江北淮東道（揚州路）、山北遼東道（大寧路）。
- 江南十道（江南行台に隷す）：江東建康道（寧国路）、江西湖東道（龍興路）、江南浙西道（杭州路）、浙東海右道（婺州路）、江南湖北道（武昌路）、嶺北湖南道（天臨路）、嶺南広西道（静江府）、海北広東道（広州路）、海北海南道（雷州路）、福建閩海道（福州路）。
- 陝西四道（陝西行台に隷す）：陝西漢中道（鳳翔府）、河西隴北道（甘州路）、西蜀四川道（成都路）、雲南諸路道（中慶路）。